Прошло три года после возвращения «Ямато» с Искандера. Земля восстановила планету с помощью Космореверс, с Гамилусом заключён мирный договор, а флот получил новый флагман — броненосец «Андромеда». Но Старша просит иного: военная экспансия набирает обороты, и цена такого «мира» измеряется тысячами жизней. «Ямато» оказывается втянут в эту гонку, хотя его роль всё больше напоминает орудие, а не спасение.

Пока Земля готовится к новым конфликтам, богиня Тереза обращается к экипажу «Ямато» с призывом. Её молитвы о спокойствии в космосе связаны с надвигающейся угрозой со стороны Гатлантиса — силы, что охватывает всю вселенную. Кораблю предстоит вновь выйти в плавание, чтобы встретить врага, который ещё не показал своих истинных масштабов.

Это продолжение классической истории о «Ямато», где личные драмы и военная машина переплетаются. Экипаж вынужден делать выбор между верностью приказу и собственной совестью, а цена каждой победы становится всё выше.